Open Science Days@Uga 2024

 Summary

Session 2 : Assurer les conditions de la réutilisabilité

09h15 - 09h45 | Intégrité des données

• Carole Chapin (OFIS)

Résumé : Le Code de Conduite Européen pour l’intégrité en recherche décrit l’intégrité scientifique d’après 4 principes, dont celui d’honnêteté, « autrement dit élaborer, entreprendre, évaluer, déclarer et faire connaître la recherche d’une manière transparente, juste, complète et objective. » En application concrète de ce principe, le code de la recherche français, dans ses articles dédiés à l’intégrité scientifique, inscrit la promotion de « la diffusion des publications en accès ouvert et [de] la mise à disposition des méthodes, protocoles, données et codes sources associés aux résultats de la recherche » parmi les missions des établissements publics de recherche. Au sein de l’ensemble des pratiques de recherche responsables, science ouverte et intégrité scientifique sont explicitement liées par les exigences de reproductibilité et de traçabilité. L’ouverture des données de la recherche est un des leviers de cette transparence, utile au partage des savoirs et à la multiplication des opportunités de dialogue entre pairs. Cette ouverture ne pouvant pourtant, seule, être une garantie d’intégrité scientifique, cette présentation reviendra sur les bonnes pratiques de l’interface entre intégrité scientifique et science ouverte, et sur les implications concrètes de leur mise en œuvre, en particulier en matière de fiabilité des données.

09h45 -11h00 | Table ronde "Comment trouver des données ? Quels freins à l'ouverture et les  difficultés rencontrées ? Point de vue des chercheurs"

• Anne Garcia-Fernandez (Litt&Arts-UGA)
• Hervé Rostaing (IMSIC-AMU)
• Benjamin Lemasson (GIN-UGA)
• Helle Pedersen (Isterre-UGA)

11h00 - 11h20 | Pause

11h20 - 12h30 | Success stories réutilisation des données

• Christophe Dutang (Laboratoire Jean Kuntzmann-UGA)

Exemple d'utilisation des bases MeteoFrance en actuariats

Résumé : La présentation se déroule en 3 temps: accès aux bases MeteoFrance, utilisation pour un projet de modèle interprétable en actuariat, diffusion du projet.

• Pierre Poulain (Institut Jacques Monod)

Partage et réutilisation des données de simulations de dynamique moléculaire : qu'avons-nous raté ?

Résumé : Les besoins de reproductibilité et l'essor de la science ouverte ont conduit au partage et au stockage des données de la recherche dans de multiples entrepôts de données. En biologie, certaines communautés bien organisées (notamment en génomique) disposent d'entrepôts de données spécialisés et réputés, mais ceci n'est pas le cas partout. Ainsi, l'absence d'entrepôt de données dédié aux simulations de dynamique moléculaire a conduit à l'accumulation de fichiers de simulation dans des entrepôts généralistes, constituant ce que nous appelons la « matière noire » de la dynamique moléculaire : des données techniquement accessibles, mais ni indexées, ni annotées, ni facilement réutilisables. Avec le projet MDverse, nous avons répertorié plusieurs centaines de milliers de fichiers de dynamique moléculaire. À partir de quelques exemples, nous illustrerons le potentiel offert par ces données. Nous soulignerons également le rôle crucial joué par les métadonnées. Enfin, nous discuterons des stratégies possibles pour créer des métadonnées lorsqu'elles n'existent pas, afin de favoriser la réutilisation des données de dynamique moléculaire.